Mark Renton indexofire

Docker Hub 镜像加速器

国内从 Docker Hub 拉取镜像有时会遇到困难，此时可以配置镜像加速器。

Dockerized 实践 https://github.com/y0ngb1n/dockerized

1️⃣ Docker daemon 配置代理（推荐）

参考 Docker daemon 配置代理

Miseq 下机数据分析应用实例

在Miseq上通过对24个混合样本的PE测序，获得的下机PF Data，从QC到de novo assembly过程的基本操作流程。

1. 前期处理

1.1 分样

####install pip and virtualenv

$ sudo aptitude install python-setuptools python-pip
$ sudo pip install virtualenv

#easy_install
#easy_install pip
#pip install everything
#sudo pip install web.py

	# game
	for i in range(1, 10):
	for j in range(1, 10):
	print(cmp(i, j))

	def cmp(a, b, n=1, ia=0, ib=0):
	if a > 10: a -= 10
	if b > 10: b -= 10
	if n == 1:
	ia = a and ib = b

	def findNextCellToFill(grid, i, j):
	"""
	遍历九宫格

	如果九宫格内含有0，表示没有解决；
	如果九宫格内不含有0，表示得到结果，循环终止
	"""
	# 检查第i行是否有0
	for x in range(i,9):
	for y in range(j,9):

	import subprocess


	subprocess.call("abyss-pe k=51 n=10 in='reads1.fa reads2.fa' name=abyss_assembly", shell=True)