kmry

Example for discussion: https://discuss.streamlit.io/t/how-to-evolve-complex-state-e-g-annotate-data/

Install the requirements.

fastapi==0.42.0
streamlit==0.49.0
uvicorn==0.9.1

Run the server.

Dockerコンテナをつくる on MacOSX

2015.2.2-6 国内版Biohackathon14.14 にて
再現性のあるサイエンスのための Docker/BioDevOps
- Docker野郎Dチーム

bioな分野でDockerを使うとなにがいいのか

コンピュータによるデータ解析をだれでもどこでもコマンド一発で再現できるのが素敵
- エヴァンジェリスト@iNut氏談
バイオインフォマティクスの参入障壁の一つであるマシン環境設定も考慮しなくていい
いままで環境構築に時間を費やしがちだった講習会などでも便利そう

初めに

本稿ではNim言語 (旧称: Nimrod) の構文を紹介します。

Nim言語の概要やインストール方法については、ブログ記事があるのでそちらをご参照下さい。

Nimの紹介 − Python風静的型付言語〜コンパイラと型推論を添えて〜

断り書き

Hapmapに登録された89のアジア人(中国人45人、日本人44人)における83534SNPsの解析

PLINK Web site : http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/
PLINK Tutorial : http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/tutorial.shtml

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あらかじめ準備しておく事

コンソール画面でRとlinuxコマンドが使える環境(more、sort、headとか)
PLINKのダウンロード、インストール（PLINK Web siteから)
hapmap1.zipのダウンロード（PLINK Tutorialから)

Performance of Flask, Tornado, GEvent, and their combinations

Wensheng Wang, 10/1/11

Source: http://blog.wensheng.org/2011/10/performance-of-flask-tornado-gevent-and.html

When choosing a web framework, I pretty much have eyes set on Tornado. But I heard good things about Flask and Gevent. So I tested the performance of each and combinations of the three. I chose something just a little more advanced than a "Hello World" program to write - one that use templates. Here are the codes:

1, Pure Flask (pure_flask.py)

コミットするまでの流れ

前回のコミットから何も変更を加えていない状態。

$ git status
# On branch masternothing to commit, working directory clean

エディタでファイルを編集する

	# An Example of how to parse command line arguments in streamlit.
	# This is free and unencumbered software released into the public domain.
	import os
	import sys
	import random
	import argparse
	import streamlit as st

	parser = argparse.ArgumentParser(description='This app lists animals')

	１）RethinkDB Serverをインストールする。
	以下のコマンドを実行していけばインストール可能。

	$ source /etc/lsb-release && echo "deb http://download.rethinkdb.com/apt $DISTRIB_CODENAME main" \| sudo tee /etc/apt/sources.list.d/rethinkdb.list
	$ wget -qO- https://download.rethinkdb.com/apt/pubkey.gpg \| sudo apt-key add -
	$ sudo apt-get update
	$ sudo apt-get install rethinkdb

	起動してみる。
	$ rethinkdb

	var fs = require("fs");
	var path = require("path");
	var app = require("app");
	var dialog = require('dialog');
	var BrowserWindow = require('browser-window');
	var ipc = require("ipc");

	function ApplicationContext(title, defaultRoute, filter) {
	this.title = title;
	this.filter = filter;